Luận án Một số đặc điểm dịch tễ học, lâm sàng và sinh học phân tử của vi rút dengue ở bệnh nhân sốt xuất huyết dengue tại bệnh viện đa khoa tỉnh Đắk lắk, 2010 - 2016

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ 
VIỆN VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƢƠNG 
-----------------*------------------- 
ĐOÀN HỮU THIỂN 
MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC, LÂM SÀNG 
VÀ SINH HỌC PHÂN TỬ CỦA VI RÚT DENGUE 
Ở BỆNH NHÂN SỐT XUẤT HUYẾT DENGUE TẠI 
BỆNH VIỆN ĐA KHOA TỈNH ĐẮK LẮK, 2010 - 2016 
Chuyên ngành : Dịch tễ học 
Mã số : 62.72.01.17 
LUẬN ÁN TIẾN SĨ Y HỌC 
HÀ NỘI – 2017 
i 
BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO BỘ Y TẾ 
VIỆN VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƢƠNG 
-----------------*------------------- 
ĐOÀN HỮU THIỂN 
MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC, LÂM SÀNG 
VÀ SINH HỌC PHÂN TỬ CỦA VI RÚT DENGUE 
Ở BỆNH NHÂN SỐT XUẤT HUYẾT DENGUE TẠI 
BỆNH VIỆN ĐA KHOA TỈNH ĐẮK LẮK, 2010 - 2016 
Chuyên ngành : Dịch tễ học 
Mã số : 62.72.01.17 
LUẬN ÁN TIẾN SỸ Y HỌC 
Người hướng dẫn khoa học: 
1. GS.TS. PHAN THỊ NGÀ 
2. GS.TS. ĐẶNG TUẤN ĐẠT 
HÀ NỘI - 2017 
ii 
LỜI CAM ĐOAN 
Tôi xin cam đoan đây là công trình nghiên cứu của tôi với sự hợp tác 
của các đồng nghiệp và đã đƣợc sự đồng ý cho công bố trong luận án này. 
Kết quả nêu trong luận án là trung thực và chƣa từng công bố trong bất kỳ 
một công trình nào khác. 
Tôi xin chịu hoàn toàn trách nhiệm về những lời cam đoan của tôi. 
 Tác giả 
NCS. Đoàn Hữu Thiển 
iii 
LỜI CẢM ƠN 
Tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành nhất tới Ban Lãnh đạo Viện Vệ sinh 
dịch tễ Trung ƣơng; Ban Lãnh đạo Viện Vệ sinh dịch tễ Tây Nguyên; Ban 
Lãnh đạo bệnh viện Đa Khoa tỉnh Đắk Lắk; Ban Lãnh đạo Viện Kiểm định 
Quốc gia Vắc xin và Sinh phẩm Y tế; Khoa VR, Khoa Đào tạo và Quản lý 
khoa học và các thầy cô giáo đã tạo mọi điều kiện thuận lợi, giúp đỡ tôi trong 
suốt quá trình học tập và hoàn thiện luận án. 
Tôi xin đƣợc bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc tới GS.TS. Phan Thị Ngà và 
GS.TS. Đặng Tuấn Đạt, những thầy cô đã trực tiếp hƣớng dẫn, động viên 
khích lệ, tận tình giúp đỡ và định hƣớng tôi trong suốt thời gian học tập, 
nghiên cứu và thực hiện luận án này. 
Tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành tới GS.TS. Phạm Ngọc Đính, nguyên 
Bí thƣ Đảng ủy, Phó Viện trƣởng Viện Vệ sinh dịch tễ Trung ƣơng, nguyên 
Phó Tổng biên tập Tạp chí Y học dự phòng đã đóng góp những ý kiến quý 
báu để tôi hoàn thành luận án. 
Tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành tới các bệnh nhân và thân nhân của gia 
đình bệnh nhân điều trị tại Bệnh viện Đa khoa Tỉnh Đắk Lắk đã ủng hộ tôi trong 
suốt quá trình nghiên cứu, để có số liệu giá trị và trung thực trong luận án. 
Cuối cùng tôi xin cảm tạ những tình cảm vô bờ bến của gia đình lớn và 
nhỏ thân yêu, cùng bạn bè, đồng nghiệp đã giúp đỡ và động viên tôi trong 
những ngày tháng học tập và nghiên cứu. 
Hà Nội, ngày tháng năm 2017 
iv 
MỤC LỤC 
TRANG PHỤ BÌA ............................................................................................. i 
LỜI CAM ĐOAN ............................................................................................. ii 
LỜI CẢM ƠN .................................................................................................. iii 
MỤC LỤC ...................................................................................................... iv 
DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT ............................................................. vii 
DANH MỤC HÌNH ......................................................................................... ix 
DANH MỤC BẢNG ........................................................................................ xi 
ĐẶT VẤN ĐỀ ................................................................................................... 1 
CHƢƠNG 1: TỔNG QUAN ............................................................................. 3 
1.1. Dịch tễ học sốt xuất huyết dengue ............................................................. 3 
1.1.1. Tác nhân gây bệnh ............................................................................ 3 
1.1.2. Ổ chứa vi rút trong tự nhiên, nguồn truyền nhiễm ........................... 4 
1.1.3. Đƣờng lây .......................................................................................... 5 
1.1.4. Khối cảm thụ ..................................................................................... 5 
1.1.5. Yếu tố liên quan ................................................................................ 6 
1.1.6. Véc tơ truyền bệnh ............................................................................ 6 
1.1.7. Phòng bệnh ........................................................................................ 7 
1.2. Đặc điểm dịch tễ học sốt xuất huyết dengue trên thế giới ......................... 8 
1.2.1. Lịch sử xuất hiện và lan truyền sốt xuất huyết dengue ..................... 8 
1.2.2. Khối cảm thụ ................................................................................... 13 
1.2.3. Mùa dịch, yếu tố liên quan .............................................................. 13 
1.2.4. Véc tơ truyền bệnh .......................................................................... 13 
1.2.5. Dự phòng bệnh ................................................................................ 14 
1.3. Đặc điểm dịch tễ học sốt xuất huyết dengue tại Việt Nam ...................... 14 
1.3.1. Tác nhân gây bệnh .......................................................................... 14 
1.3.2. Tình hình sốt xuất huyết dengue ở Việt Nam ................................. 15 
1.3.3. Khối cảm thụ ................................................................................... 17 
1.3.4. Mùa dịch ......................................................................................... 18 
1.3.5. Véc tơ truyền bệnh .......................................................................... 19 
1.3.6. Phòng bệnh ...................................................................................... 19 
1.3.7. Một số đặc điểm về sốt xuất huyết dengue ở khu vực Tây Nguyên .. 20 
v 
1.4. Mối liên quan giữa đặc điểm lâm sàng và týp vi rút gây bệnh ................ 23 
1.4.1. Đặc điểm lâm sàng và cận lâm sàng của SXHD ............................ 23 
1.4.2. Chẩn đoán xác định ......................................................................... 27 
1.4.3. Tình trạng lâm sàng liên quan với các týp vi rút dengue gây bệnh 29 
1.5. Đặc điểm sinh học phân tử các týp vi rút dengue .................................... 31 
1.5.1. Đặc điểm sinh học phân tử các týp vi rút dengue trên thế giới ...... 31 
1.5.2. Đặc điểm sinh học phân tử các týp vi rút dengue tại Viêt Nam ..... 34 
Chƣơng 2: ĐỐI TƢỢNG VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN CỨU .................. 36 
2.1. Đối tƣợng nghiên cứu............................................................................... 36 
2.1.1. Đối tƣợng của mục tiêu 1 ................................................................ 36 
2.1.2. Đối tƣợng của mục tiêu 2 ................................................................ 36 
2.1.3. Đối tƣợng của mục tiêu 3 ................................................................ 36 
2.1.4. Tiêu chuẩn lựa chọn hoặc loại trừ đối tƣợng nghiên cứu ............... 36 
2.2. Thời gian, địa điểm nghiên cứu nghiên cứu: 2010-2016 tại bệnh viện Đa 
khoa tỉnh Đắk Lắk. ................................................................................. 38 
2.3. Phƣơng pháp nghiên cứu .......................................................................... 38 
2.3.1. Phƣơng pháp nghiên cứu mục tiêu 1 .............................................. 39 
2.3.2. Phƣơng pháp nghiên cứu mục tiêu 2 .............................................. 44 
2.3.3. Phƣơng pháp nghiên cứu mục tiêu 3 .............................................. 46 
2.4. Các chỉ số nghiên cứu .............................................................................. 48 
2.4.1. Các chỉ số nghiên cứu mục tiêu 1 ................................................... 48 
2.4.2. Các chỉ số về đặc điểm lâm sàng và mối liên quan đến sự lƣu hành 
các týp vi rút dengue trong nghiên cứu mô tả 2010 - 2016 .............. 49 
2.4.3. Một số đặc điểm sinh học phân tử các genotýp của từng týp vi rút 
dengue ở Đắk Lắk, 2010 - 2016....................................................... 49 
2.5. Các biện pháp hạn chế sai số ................................................................... 50 
2.6. Phƣơng pháp xử lý số liệu ........................................................................ 50 
2.7. Đạo đức trong nghiên cứu ........................................................................ 51 
Chƣơng 3: KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU ........................................................... 52 
3.1. Kết quả mô tả đặc điểm dịch tễ học và yếu tố liên quan của SXHD ở tỉnh 
Đắk Lắk, 2010-2016 ............................................................................... 52 
vi 
3.1.1. Một số đặc điểm dịch tễ học ........................................................... 52 
3.1.2. Một số yếu tố liên quan ................................................................... 56 
3.2. Kết quả xác định một số đặc điểm lâm sàng sốt xuất huyết dengue và sự 
liên quan với các týp vi rútgây bệnh ở tỉnh Đắk Lắk, 2010-2016 .......... 59 
3.3. Kết quả xác định một số đặc điểm sinh học phân tử các týp vi rút dengue 
lƣu hành ở Đắk Lắk, Tây Nguyên 2010-2016 ........................................ 67 
Chƣơng 4: BÀN LUẬN .................................................................................. 79 
4.1. Một số đặc điểm dịch tễ học và yếu tố liên quan của sốt xuất huyết 
dengue ở tỉnh Đắk Lắk, 2010-2016 ........................................................ 79 
4.2. Một số đặc điểm lâm sàng sốt xuất huyết dengue và sự liên quan với các 
týp vi rút dengue gây bệnh ở tỉnh Đắk Lắk, 2010-2016 ......................... 87 
4.3. Một số đặc điểm sinh học phân tử các týp vi rút dengue lƣu hành ở Đắk 
Lắk, Tây Nguyên 2010-2016 .................................................................. 97 
4.4. Hạn chế của nghiên cứu ......................................................................... 104 
KẾT LUẬN ................................................................................................... 106 
KIẾN NGHỊ .................................................................................................. 108 
CÁC CÔNG TRÌNH CÔNG BỐ LIÊN QUAN ĐẾN LUẬN ÁN 
TÀI LIỆU THAM KHẢO 
PHỤ LỤC 
Phụ lục 1. Phiếu điều tra về dịch tễ và các yếu tố liên quan của sốt xuất huyết 
dengue 
Phụ lục 2. Phiếu điều tra hồi cứu ca bệnh sốt xuất huyết dengue 
Phụ lục 3. Danh sách các chủng VR dengue phân lập từ bệnh nhân ở bệnh 
viện Đa khoa tỉnh Đắk Lắk, 2010-2016 
Phụ lục 4. Mã số trong Genbank một phần vùng gen C-PrM của các chủng VR 
dengue phân lập từ bệnh nhân tại Đắk Lắk, Tây Nguyên, 2010-2016 
Phụ lục 5. Danh sách các chủng VR dengue tham khảo sử dụng để xây dựng 
cây phát sinh loài 
vii 
DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT 
TỪ VIẾT TẮT TỪ TIẾNG ANH TỪ- NGHĨA TIẾNG VIỆT 
Arbo Arthropodborne Mang bởi côn trùng tiết túc 
ADN Desoxyribonucleic Axit Đêzôxiribonuclêic 
ARN Ribonucleic acid Axit ribonucleic 
BSA Bovine Serum Albubumin Albumin bò 
cDNA Complement DNA ADN bổ sung 
DENV-1 Dengue virus type 1 VR dengue type 1 
DENV-2 Dengue virus type 2 VR dengue type 2 
DENV-3 Dengue virus type 3 VR dengue type 3 
DENV-4 Dengue virus type 4 VR dengue type 4 
dNTP Deoxynucleotide triphosphate 
ddNTP Dideoxynucleotide triphosphate 
ELISA Enzyme Linked Immunorbent assay Thử nghiệm miễn dịch gắn enzyme 
FBS Fetal bovine serum huyết thanh bê bào thai 
GAC-ELISA IgG antibody capture ELISA Kỹ thuật ELISA tóm bắt IgG 
HCSD Hội chứng sốc dengue 
HRPO Horseradis Peroxidase 
HT Huyết thanh 
KN Kháng nguyên 
KT Kháng thể 
MAC-ELISA IgM Antibody Capture ELISA Kỹ thuật ELISA tóm bắt IgM 
MEM Minium Essential Medium Môi trƣờng thiết yếu 
OD Opital density Mật độ quang học 
ỎR Odd ratio Tỉ số chênh 
PBS Phosphate Buffer Saline Đệm muối phốt phát. 
viii 
P Probability Xác suất 
RT-PCR Reverse transcriptaze polymerase 
chain reaction 
Phản ứng chuỗi phiên mã ngƣợc 
SD Standard Deviation Độ lệch chuẩn 
SD/DF Dengue fever Sốt dengue 
SXHD/DHF Dengue heamrrhagic fever Sốt xuất huyết dengue 
SOP Standard operation procedure Quy trình chuẩn 
TAE Tris- Acetate – EDTA 
VVSDTTƢ Viện Vệ sinh Dich tễ Trung ƣơng 
VR VR 
YF Yellow fever Sốt vàng 
WHO-TCYTTG World Health Organization Tổ chức Y tế Thế giới 
ix 
DANH MỤC HÌNH 
Hình 1.1. Hình dạng bên ngoài của vi rút dengue ....................................... 3 
Hình 1.2. Cấu trúc bên trong của vi rút dengue ............................................ 3 
Hình 1.3. Sơ đồ bộ gen của vi rút Dengue ................................................... 4 
Hình 1.4. Các khu vực có dịch SXHD trên thế giới ..................................... 9 
Hình 1.5. Ranh giới các khu vực có nguy cơ lây nhiễm dengue ................ 10 
Hình 1.6. Số mắc sốt xuất huyết dengue trên thế giới, 1955-2010 ............ 11 
Hình 1.7. Bản đồ phân bố ca mắc SXHD ở Đông Nam Á, 1998-2012 ..... 12 
Hình 1.8. Sự lƣu hành các týp vi rút dengue tại Việt Nam 1991-2012 ...... 14 
Hình 1.9. Số mắc sốt xuất huyết dengue ở Việt Nam trên 100.000 dân .... 17 
Hình 1.10. Số mắc SXHD theo tháng của Việt Nam,2014, 2015 và đƣờng 
trung bình dịch giai đọan 2010-2014 .......................................... 18 
Hình 1.11. Số mắc sốt SXHD/100.000 dân của 4 tỉnh ở Tây Nguyên, 
2005-2014 ................................................................................... 21 
Hình 1.12. Số mắc SXHD/100.000 dân của tỉnh Đắk Lắk và khu vực Tây 
Nguyên, 2010-2016 .................................................................... 22 
Hình 1.13. Số mắc SXHD theo tháng ở Tây Nguyên, 2005-2014 .................... 23 
Hình 1.14. Sự phân bố và phát tán của các týp VR dengue 1970 ............... 31 
Hình 1.15. Sự phân bố và phát tán của các týp vi rút dengue 2004 ............ 31 
Hình 2.1. Thiết kế nghiên cứu .................................................................... 38 
Hình 2.2. Kỹ thuật RT-PCR trong chẩn đoán SXHD của Lancioti ........... 43 
Hình 2.3. Điện di sản phẩm PCR với mồi đặc hiệu týp vi rút dengue ....... 44 
Hình 2.4. Quy trình xây dựng cây di truyền phả hệ các chủng VR 
dengue ......................................................................................... 48 
Hình 3.1. Sự phân bố theo tháng của các trƣờng hợp SXHD .................... 54 
Hình 3.2. Một số triệu chứng nhiễm vi rút trong ngày nhập viện liên 
quan đến týp VR của bệnh nhân SXHD, 2010–2016 ................. 61 
x 
Hình 3.3. Biểu hiện cô đặc máu ở bệnh nhân SXHD qua một số xét 
nghiệm máu tại bệnh viện Đa khoa Đắk Lắk, 2010-2016 .......... 63 
Hình 3.4. Cây phát sinh loài dựa trên trình tự nucleotide một phần vùng gen 
C-PrM của vi rút dengue týp 1 ở Đắk Lắk, 2010–2016 và chủng 
tham khảo..................................................................................... 69 
Hình 3.5. Cây phát sinh loài dựa trên trình tự nucleotide một phần vùng gen 
C-PrM của vi rút dengue týp 2 ở Đắk Lắk, 2010 ... ắk Lắk 1 LC311807 
15 D797N/16 2016 Đắk Lắk 1 LC311808 
16 D72DL/10 2010 Đắk Lắk 2 LC311809 
17 D69GL/10 2010 Gia Lai 2 LC311810 
18 D30DN/11 2011 Đắk Nông 2 LC311811 
19 D28GL/12 2012 Gia Lai 2 LC311812 
20 D9GL/12 2012 Gia Lai 2 LC311813 
STT 
Ký hiệu 
chủng 
Năm 
phân lập 
Tỉnh Type 
Số đăng ký trên 
ngân hàng gen 
21 D73GL/13 2013 Gia Lai 2 LC311814 
22 D07KT/14 2014 Kon Tum 2 LC311815 
23 D22DL/14 2014 Đắk Lắk 2 LC311816 
24 D686N/16 2016 Đắk Lắk 2 LC311817 
25 D678N/16 2016 Đắk Lắk 2 LC311818 
26 D677N/16 2016 Đắk Lắk 2 LC311819 
27 D26GL/10 2010 Gia Lai 3 LC311820 
28 D168DL/13 2013 Đắk Lắk 3 LC311821 
29 D1DN/13 2013 Đắk Nông 3 LC311822 
30 D03KT/14 2014 Kon Tum 3 LC311823 
31 D07DN/14 2014 Đắk Nông 3 LC311824 
32 D08KT/14 2014 Kon Tum 3 LC311825 
33 D09KT/14 2014 Kon Tum 3 LC311826 
34 D11DL/14 2014 Đắk Lắk 3 LC311827 
35 D15DL/14 2014 Đắk Lắk 3 LC311828 
36 D16DL/14 2014 Đắk Lắk 3 LC311829 
37 D23DL/14 2014 Đắk Lắk 3 LC311830 
38 D25DL/14 2014 Đắk Lắk 3 LC311831 
39 D26DL/14 2014 Đắk Lắk 3 LC311832 
40 D65DN/14 2014 Đắk Nông 3 LC311833 
41 D67DN/14 2014 Đăk Nông 3 LC311834 
42 D178P/15 2015 Đắk Lắk 4 LC311835 
43 DL16GL/10 2010 Gia Lai 4 LC311836 
44 D425N/15 2015 Đắk Lắk 4 LC311837 
STT 
Ký hiệu 
chủng 
Năm 
phân lập 
Tỉnh Type 
Số đăng ký trên 
ngân hàng gen 
45 D676N/16 2016 Đắk Lắk 4 LC311838 
46 D140N/15 2015 Đắk Lắk 4 LC311839 
47 D419N/15 2015 Đắk Lắk 4 LC311840 
48 D005N/16 2016 Đắk Lắk 4 LC311841 
49 D026N/16 2016 Đắk Lắk 4 LC311842 
50 D027N/16 2016 Đắk Lắk 4 LC311843 
51 D16GL/13 2013 Gia Lai 4 LC311844 
52 D015N/16 2016 Đắk Lắk 4 LC311845 
53 D022N/16 2016 Đắk Lắk 4 LC311846 
54 D158N/16 2016 Đắk Lắk 4 LC311847 
55 D674N/16 2016 Đắk Lắk 4 LC311848 
56 D028N/16 2016 Đắk Lắk 4 LC311849 
PHỤ LỤC 5 
Danh sách các chủng VR dengue tham khảo sử dụng để xây dựng cây 
phát sinh loài 
VR dengue týp 1 
STT Ký hiệu chủng 
Mã số 
Genbank 
Năm Địa điểm Vật chủ 
1 DENV-1/VN/BID-
V1689/2007 
FJ024459 2007 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
2 DENV-1/VN/BID-
V1553/2007 
EU677175 2007 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
3 DENV-1/VN/BID-
V1664/2007 
FJ182032 2007 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
4 DENV-1/VN/BID-
V1664/2007 
FJ410207 
2007 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
5 DENV-1/VN/BID-
V1904/2008 
FJ410240 2008 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
6 DENV-1/VN/BID-
V1785/2007 
FJ432730 2007 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
7 DENV-1/VN/BID-
V2686/2006 
FJ882517 2006 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
8 DENV-1/VN/BID-
V2814/2007 
FJ882558 2007 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
9 DENV-1/VN/BID-
V2903/2006 
FJ898418 2006 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
10 DENV-1/VN/BID-
V2907/2006 
FJ898422 2006 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
11 DENV-1/VN/BID-
V2736/2007 
FJ906964 2007 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
12 DENV-1/VN/BID-
V2737/2007 
FJ906965 2007 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
13 DENV-1/VN/BID-
V2875/2006 
GQ199842 2006 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
14 DENV-1/VN/BID-
V2713/2006 
GQ868606 2006 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
15 DENV-1/VN/BID-
V2909/2006 
GQ868613 2006 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
16 DENV-1/VN/BID-
V3851/2008 
GU131687 2008 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
17 DENV-1/VN/BID-
V1535/2007 
EU677162 2007 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
18 DENV-
1/KHM/2001 L1108177 
AF538031 2001 Campuchia Ngƣời 
19 DENV-1/KHM/2001 
L1117016 
AF538026 2001 Campuchia Ngƣời 
20 DENV-
1/Laos/SV2951/2007 
HM469968 
2007 Thái Lan Ngƣời 
21 DENV-1/Laos/SV36/2008 KC172833 2008 Lào Ngƣời 
22 D1/SG/05K4820DK1/2005 EU081279 2005 Singapore / 
22 D1/SG/05K4632DK1/2005 EU081278 2005 Singapore / 
23 D1/SG/06K2236DK1/2006 EU081280 2006 Singapore / 
24 D1/SG/06K2290DK1/2006 EU081281 2006 Singapore / 
25 DENV-
1/AUS/TSV08/2008 
KR919821 2008 Australia Ngƣời 
26 DENV-1/IDN/MKS-
2094/2008 
KC762644 2008 Indonesia Ngƣời 
27 
DENV-1/IDN/MKS-
0398/2008 
KC762643 2008 Indonesia Ngƣời 
28 DENV-1/IDN/MKS-
0352/2007 
KC762637 2007 Indonesia Ngƣời 
29 D1/SG/05K4621DK1/2005 EU081276 2005 Singapore / 
30 DENV-
1/Laos/UI13412/2008 
KC172835 2008 Lào Ngƣời 
31 D1/CHN/GD66/03/2003 FJ196842 2003 Trung 
Quốc 
Muỗi 
32 D1/IND/98901530-DF/ AB189121 1998 Indonesia Ngƣời 
33 D1/MAL/P72-1244/1972/ EF457905 1972 Malaysia / 
34 D1.Myanmar.40553/71 AY713473 1971 Myanmar / 
35 D1.Myanmar.40568/76 AY722801 1976 Myanmar / 
36 D1/VG/BID-V2937/1985 GQ868601 1985 Tortola Ngƣời 
37 D1/BR/BID-V2389/2004 FJ850081 2004 Brazil Ngƣời 
38 D1/Reunion/191/04/2004 DQ285559 2004 Reunion Ngƣời 
39 D1/Venezela/BID-
V2169/1998 
FJ639741 1998 Venezuela Ngƣời 
40 D1/US/BID-V2096/1993 FJ562105 1993 Puerto 
Rico 
Ngƣời 
41 D1/BR/97-111 /1997 AF311956 / Brazil Ngƣời 
VR dengue týp 2 
STT Ký hiệu chủng 
Mã số 
Genbank 
Năm Địa điểm Vật chủ 
1 DENV-2/KH/BID-
V2042/2005 
FJ639708 2005 Campuchia Ngƣời 
2 DENV-2/KH/BID-
V2041/2004 
FJ639707 2004 Campuchia Ngƣời 
3 DENV-2/TH/BID-
V2957/2003 
FJ898452 2003 Thái Lan Ngƣời 
4 DENV-2/TH/BID-
V4325/2001 
GU131886 2001 Thái Lan Ngƣời 
5 DENV-2/TH/Seq35 KY586625 2010 Thái Lan Ngƣời 
6 DENV-2/TH/Seq49 KY586690 1999 Thái Lan Ngƣời 
7 DENV-2/VN/CSF63/2004 FM210214 2004 Miền 
Nam-VN 
/ 
8 DENV-2/VN/DF907/2003 FM210211 2003 Miền 
Nam-VN 
/ 
9 DENV-2/VN/BID-
V753/2004 
EU482775 2004 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
10 DENV-2/VN/BID-
V1844/2008 
FJ410215 2008 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
11 DENV-2/TH/Seq30 KY586597 2009 Thái Lan Ngƣời 
12 DENV-2/KH/BID-
V2068/2008 
FJ639718 2008 Campuchia Ngƣời 
13 DENV-2/VN/BID-
V1818/2007 
FJ410208 2007 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
14 DENV-2/VN/MD1618/2005 FM210246 2005 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
15 DENV-2/VN/MD1619/2005 FM210207 2005 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
16 DENV-2/VN/BID-
V1905/2008 
FJ410241 2008 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
17 DENV-2/VN/MD1520/2005 FM210245 2005 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
18 DENV-2/VN/MD1533/2005 FM210205 2005 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
19 DENV-2/VN/BID-
V1858/2007 
FJ461314 2007 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
20 DENV-2/VN/BID-
V921/2006 
EU482467 2006 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
21 DENV-2/IPC/BID-
V3796/2008 
GU131899 2008 Campuchia Ngƣời 
22 DENV-2/VN/BID-
V922/2006 
FJ873811 2006 Miền 
Nam-VN 
Ngƣời 
23 DENV-2/TH/BID-
V3357/1964 
GQ868591 1964 Thái Lan Ngƣời 
24 DENV-2/PE/IQA 
2080/2010 
KC294221 2010 Peru Ngƣời 
25 DENV-2/PE/NFI1159/2010 KC294223 2010 Peru Ngƣời 
26 DENV-2/GU/FDA-
GUA09/2009 
HQ999999 2009 Guatemala Ngƣời 
27 DENV-2/CHN/04/1985 AF11966 1985 Trung 
Quốc 
Ngƣời 
28 DENV-2/ID/1022DN/1975 GQ398268 1975 Indonesia Ngƣời 
29 DENV-2/NewGuineaC/1944 KM204118 1944 New 
Guinea 
Ngƣời 
30 DENV-2/CHN/43 AF204178 1987 Trung 
Quốc 
Ngƣời 
31 DENV-2/US/BID-
V5412/2007 
JF730050 2007 Mỹ Ngƣời 
32 DENV-2/US/BID-
V5055/2008 
JN796245 2008 Mỹ Chuột Mus 
musculus 
33 DENV-2/TW/BID-
V5056/2008 
HQ891024 2008 Đài Loan Chuột Mus 
musculus 
34 D2/Pakistan/2011-23/2011 KF041232 2011 Pakistan Ngƣời 
35 D2/Pakistan/2011-4/2011 KF041234 2011 Pakistan Ngƣời 
36 D2/Pakistan/2011-3/2011 KF041233 2011 Pakistan Ngƣời 
37 DENV-2/IND/Od2112/2009 JQ955624 2011 Ấn Độ Ngƣời 
38 DENV-2/IN/BID-
V2961/2006 
FJ898454 2006 Ấn Độ Ngƣời 
39 DENV-2/ID/1016DN/1975 GQ398258 1975 Indonesia Ngƣời 
40 DENV-2/ID/1017DN/1976 GQ398259 1976 Indonesia Ngƣời 
41 DEV-2/Taiwan/1222-DF-
06/24/2002 
DQ645546 2002 Đài Loan Ngƣời 
42 DEV-
2/Brunei/DS31/291005/2005 
EU031572 2005 Brunei / 
43 DENV-2/GU/BID-
V2950/2001 
HM488257 2001 Guam Ngƣời 
44 DENV-2/SG/D2Y98P-
PP1/2009 
JF327392 2009 Singapore Ngƣời 
45 DENV-2/VN/BID-
V735/2006 
EU482672 2006 Miền 
Nam-Vn 
Ngƣời 
46 DENV-2/Brunei/DS09-
280106/2006 
EU179859 2006 Brunei / 
47 DENV-
2/IDN/98900663/1998 
AB189122 1998 Indonesia Ngƣời 
48 D2/SG/05K3295DK1/2005 EU081177 2005 Singapore / 
49 DENV-
2/CHN/GD01/03/2003 
FJ196853 2003 Trung 
Quốc 
Muỗi 
50 DENV-2/AUS/TSV01/1993 AY037116 1993 Australia Ngƣời 
51 DENV-2/IDN/BA05i/2004 AY858035 2004 Indonesia Ngƣời 
VR dengue týp 3 
STT Ký hiệu chủng 
Mã số 
Genbank 
Năm Địa điểm Vật chủ 
1 DENV-3/VN/BID-V1783/2007 FJ432728 2007 Miền Nam-VN Ngƣời 
2 DENV-3/VN/BID-V1327/2006 EU660408 2006 Miền Nam-VN Ngƣời 
3 DENV-3/VN/BID-V1786/2007 FJ432731 2007 Miền Nam-VN Ngƣời 
4 DENV-3/VN/BID-V1933/2008 KF955460 2008 Miền Nam-VN Ngƣời 
5 DENV-3/VN/BID-V1957/2008 FJ562103 2008 Miền Nam-VN Ngƣời 
6 DENV-3/VN/BID-V1330/2006 EU660410 2006 Miền Nam-VN Ngƣời 
7 DENV-3/VN/BID-V1018/2007 EU482462 2007 Miền Nam-VN Ngƣời 
8 DENV-3/VN/BID-V1009/2006 EU482453 2006 Miền Nam-VN Ngƣời 
9 DENV-3/KH/BID-V2084/2005 KF955333 2005 Campuchia Ngƣời 
10 DENV-3/KH/BID-V2092/2007 FJ639731 2007 Campuchia Ngƣời 
11 DENV-3/KH/BID-V3823/2006 HM181934 2006 Campuchia Ngƣời 
12 DENV-3/IPC/BID-V4306/2007 GU131944 2007 Campuchia Ngƣời 
13 DENV-3/IPC/BID-V3825/2006 GU131911 2006 Campuchia Ngƣời 
14 DENV-3/IPC/BID-V3809/2003 GU131906 2003 Campuchia Ngƣời 
15 DENV-3/IPC/BID-V3819/2006 GQ868634 2006 Campuchia Ngƣời 
16 DENV-3/KH/BID-V2082/2003 FJ639725 2003 Campuchia Ngƣời 
17 DENV-3/KH/BID-V4315/2008 HM631854 2008 Campuchia Ngƣời 
18 DENV-3/IPC/BID-V3808/2008 GU131905 2008 Campuchia Ngƣời 
19 DENV-3/KH/BID-V2089/2006 FJ639729 2006 Campuchia Ngƣời 
20 DENV-3/IPC/BID-V4294/2007 GU131939 2007 Campuchia Ngƣời 
21 DENV-3/IPC/BID-V3807/2003 GU131904 2005 Campuchia Ngƣời 
22 DENV-3/KH/BID-V20070/1999 KF955461 1999 Campuchia Ngƣời 
23 DENV-3/TH/Seq54 KY586772 1998 Thái Lan Ngƣời 
24 DENV-3/BLD/BDH02-03/2002 DQ401691 2002 Bangladesh / 
25 DENV-3/BLD/BDH02-04/2002 DQ401692 2002 Bangladesh / 
26 DENV-3/BD/BDH02-07/2002 DQ401693 2002 Bangladesh / 
27 DENV-3/BLD/BDH02-01/xxx DQ401689 / Bangladesh / 
28 DENV-3/TW/98TW503/1998 DQ675531 1998 Đài Loan Ngƣời 
29 DENV-3/TW/98TW388/1999 DQ675526 1998 Đài Loan Ngƣời 
30 DENV-3/TH/Seq40 KY586822 2009 Thái Lan Ngƣời 
31 DENV-3/TH/Seq38 KY586820 2008 Thái Lan Ngƣời 
32 DENV-3/TH/Seq14 KY586749 2003 Thái Lan Ngƣời 
33 DENV-3/TH/Seq33 KY586811 2009 Thái Lan Ngƣời 
34 DENV-3/TH/Seq9 KY586734 2001 Thái Lan Ngƣời 
35 DENV-3/AUS/C0360/1994 KJ737429 1994 Thái Lan Ngƣời 
36 DENV-3/TH/ThD3 1283/1998 AY676349 1998 Thái Lan / 
37 DENV-3/TH/Seq8 KY586733 2000 Thái Lan Ngƣời 
38 DENV-3/TH/Seq6 KY586716 2002 Thái Lan Ngƣời 
39 DENV-3/TWN/Taiwan-
739079A 
AY776329 / Đài Loan / 
40 DENV-3/IDN/98902890 DF 
DV-3/1998 
AB189128 1998 Indonesia Ngƣời 
41 DENV-3/IDN/PI64/2004 AY858046 2004 Indonesia Ngƣời 
42 D3/SG/05K4477DK1/2005 EU081223 2005 Singapore / 
43 DENV-3/IDN/TB16/2004 AY858047 2004 Indonesia Ngƣời 
44 DENV-3/IDN/KJ46/2004 AY858043 2004 Indonesia Ngƣời 
45 DENV-3/IDN/FW06/2004 AY858041 2004 Indonesia Ngƣời 
46 DENV-3/THA/Hu/TL 
129NIID/2005 
AB214882 2005 Timor Leste Ngƣời 
47 DENV-3/THA/Hu/TL 
029NIID/2006 
AB214880 2005 Timor Leste Ngƣời 
48 D3/Hu/TL129NIID/2005 AB214882 2005 Timor Leste Ngƣời 
49 DENV-3/TWN/99TW628/1999 DQ675533 1999 Đài Loan Ngƣời 
50 D3/H/IMTSSA-SRI/2000/1266 AY099336 / Sri Lanka / 
51 D3/SG/05K3928DK1/2005 EU081213 2005 Singapore / 
52 DENV-
3/BRZ/BR74886/02/2002 
AY679147 / Brazil / 
53 DENV-3/CO/BID-V3405/2007 GQ868578 2007 Colombia Ngƣời 
54 DENV-3/US/BID-V2118/2001 FJ547082 2001 Puerto Rico Ngƣời 
55 DENV-3/PE/BID-V7088/2005 KJ189299 2005 Peru Ngƣời 
56 DENV-3/PE/BID-V7087/2008 KJ189298 2008 Peru Ngƣời 
57 DENV-3/PE/BID-V7086/2006 KJ189297 2006 Peru Ngƣời 
58 DENV-3/US/BID-V2111/2000 FJ547076 2000 Puerto Rico Ngƣời 
59 D3/H/IMTSSA-SRI/1999/1243 NC_001475 / Sri Lanka / 
60 DENV-3/VE/BID-V2969/2003 FJ898472 2003 Venezela Ngƣời 
61 DENV-3/US/BID-V2099/1998 FJ547070 1998 Puerto Rico Ngƣời 
62 DENV-3/US/BID-V1737/1999 FJ390377 1999 Puerto Rico Ngƣời 
VR dengue týp 4 
STT Ký hiệu chủng 
Mã số 
Genbank 
Năm Địa điểm Vật chủ 
1 DENV-4/TH/Seq23 KY586880 2005 Thái Lan Ngƣời 
2 DENV-4/TH/BID-V4331/2006 KF955522 2006 Thái Lan Ngƣời 
3 DENV-4/TH/Seq24 KY586881 2004 Thái Lan / 
4 DENV-4/TH/Seq41 KY586926 2002 Thái Lan Ngƣời 
5 DENV-4/TH/Seq15 KY586865 2005 Thái Lan Ngƣời 
6 DENV-4/TH/Seq16 KY586866 2004 Thái Lan Ngƣời 
7 DENV-4/TH/Seq21 KY586877 2003 Thái Lan Ngƣời 
8 DENV-4/TH/Seq22 KY586879 2004 Thái Lan Ngƣời 
9 DENV-4/TH/Seq14 KY586862 2004 Thái Lan Ngƣời 
10 DENV-4/TH/Seq29 KY586891 2005 Thái Lan Ngƣời 
11 DENV-4/TH/Seq40 KY586924 2003 Thái Lan Ngƣời 
12 DENV-4/TH/Seq27 KY586889 2003 Thái Lan Ngƣời 
13 DENV-4/TH/Seq42 KY586893 2002 Thái Lan Ngƣời 
14 DENV-4/TH/Seq30 KY586895 2002 Thái Lan Ngƣời 
15 DENV-4/TH/Seq31 KY586896 2002 Thái Lan Ngƣời 
16 DENV-4/TH/Seq32 KY586897 2002 Thái Lan Ngƣời 
17 DENV-4/TH/Seq20 KY586874 2007 Thái Lan Ngƣời 
18 DENV-4/TH/Seq13 KY586858 2007 Thái Lan Ngƣời 
19 DENV-4/TH/Seq43 KY586894 2002 Thái Lan Ngƣời 
20 DENV-4/TH/Seq26 KY586888 2004 Thái Lan Ngƣời 
21 DENV-4/TH11/1404 KT026310 2011 Thái Lan Ngƣời 
22 DENV-4/TH11/1666 / / Thái Lan Ngƣời 
23 DENV-4/TH11/1373 KT026309 2011 Thái Lan Ngƣời 
24 DENV-4/TH11/1194 KT026308 2011 Thái Lan Ngƣời 
25 DENV-4/TH/BID-V4332/2006 KF955531 2006 Thái Lan Ngƣời 
26 DENV-4/CAM/V0624301/2011 KF543273 2011 Campuchia Ngƣời 
27 DENV-4/TH/Seq25 KY586887 2002 Thái Lan Ngƣời 
28 DENV-4/TH/BID-V4334/2006 KF955533 2006 Thái Lan Ngƣời 
29 DENV-4/CAM/U0811386/2010 KF543272 2010 Campuchia Ngƣời 
30 DENV-4/KH/BID-V3836/2007 KF955528 2007 Campuchia Ngƣời 
31 DENV-4/TH/BID-V4329/2005 KF955520 2005 Thái Lan Ngƣời 
32 DENV-4/KH/BID-V3814/2001 KF955514 2001 Campuchia Ngƣời 
33 DENV-4/KH/BID-V2058/2008 KF955513 2008 Campuchia Ngƣời 
34 DENV-4/IPC/DSS patient/2008 JN638572 2008 Campuchia Ngƣời 
35 DENV-4/IPC/DHF patient/2008 JN638571 2007 Campuchia Ngƣời 
36 DENV-4/IPC/DF patient/2008 JN638570 2008 Campuchia Ngƣời 
37 DENV-4/TH/Seq67 KY586930 2002 Thái Lan Ngƣời 
38 DENV-4/TH/Seq65 KY586928 2001 Thái Lan Ngƣời 
39 DENV-4/TH/Seq64 KY586927 2001 Thái Lan Ngƣời 
40 DENV-4/TH/Seq63 KY586925 2002 Thái Lan Ngƣời 
41 DENV-4/TH/Seq62 KY586922 1998 Thái Lan Ngƣời 
42 DENV-4/TH/Seq52 KY586912 2000 Thái Lan Ngƣời 
43 DENV-4/THA/ThD4 0348 91/1991 AY618990 1991 Thái Lan / 
44 DEV-4/SG(EHI)D4/25178Y11/2011 KP792537 2011 Singapore Ngƣời 
45 DENV-4/IND/0952326/2009 JQ922560 2009 Ấn Độ Ngƣời 
46 DENV-4/IND/793679/1979 JQ922559 1979 Ấn Độ Ngƣời 
47 DENV-4/IND/G11337/1961 JF262783 1961 Ấn Độ Ngƣời 
48 DENV-4/THA/ThD4 0017 97/1997 AY618989 1997 Thái Lan / 
49 DENV-4/THA/ThD4 0476 97/1997 AY618988 1997 Thái Lan / 
50 DENV-4/VEN/INH6412/1995 JF262781 1995 Venezuela Ngƣời 
51 DENV-4/BRA/H780571/2011 JQ513344 2011 Brazil Ngƣời 
52 DENV-4/BRZ/H778887/2011 JQ513337 2011 Brazil Ngƣời 
53 DENV-4/CO/BID-V3410/2004 GQ868583 2004 Colombia Ngƣời 
54 DENV-4/VE/BID-V2607/2006 JN819406 2006 Venezuela Ngƣời 
55 DENV-4/US/BID-V2448/1999 FJ882601 1999 Puerto Rico Ngƣời 
56 DENV-4/CHN/GD07/78/1978 FJ196849 1978 Trung Quốc Chuột 
57 DENV-4/FP/PF09/290109-69/2009 JQ915081 2009 Polynesia Ngƣời 
58 DENV-4/CHN/GZ/9809/2012 KC333651 2012 Trung Quốc Ngƣời 
59 DENV-4/SIN/EHI310A129SY10/2010 JX024758 2010 Singapore Ngƣời 
60 DENV-4/NC/NC08/200208-409/2008 JQ915085 2008 New 
Caledonia 
Ngƣời 
61 DENV-4/MAL/P73-1120/1973 JF262780 1973 Malaysia Khỉ 
62 DENV-4/MAL/P75-514/1975 AF231723 / Malaysia / 
63 DENV-4/MAL/P75-215/1975 EF457906 1975 Malaysia /